Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3bP59470 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3bP59470 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3bP59470 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3bP59470 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3bP59470 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3bP59470 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3bP59470 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3bP59470 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3bP59470 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3bP59470 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Polr3bP59470 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Polr3bP59470 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Polr3bP59470 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Polr3bP59470 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Polr3bP59470 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3bP59470 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms