Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdrg1P59048 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms