Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P58686 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P58686 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P58686 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P58686 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P58686 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P58686 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P58686 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P58686 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P58686 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P58686 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P58686 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms