Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpa1P57784 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms