Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Usp25P57080 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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Usp25P57080 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp25P57080 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp25P57080 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Usp25P57080 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Usp25P57080 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms