Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bace1P56818 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Bace1P56818 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Bace1P56818 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms