Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmoP56726 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SmoP56726 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmoP56726 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmoP56726 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmoP56726 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmoP56726 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmoP56726 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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