Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms