Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms