Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pex2P55098 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms