Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtskP55097 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtskP55097 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtskP55097 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtskP55097 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtskP55097 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtskP55097 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtskP55097 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtskP55097 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtskP55097 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtskP55097 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CtskP55097 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtskP55097 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtskP55097 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtskP55097 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtskP55097 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtskP55097 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtskP55097 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtskP55097 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtskP55097 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtskP55097 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtskP55097 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtskP55097 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtskP55097 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtskP55097 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtskP55097 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtskP55097 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtskP55097 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtskP55097 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtskP55097 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms