Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms