Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms