Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cux1P53564 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cux1P53564 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cux1P53564 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cux1P53564 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux1P53564 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux1P53564 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux1P53564 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux1P53564 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cux1P53564 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms