Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fgd1P52734 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd1P52734 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms