Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ClgnP52194 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms