Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms