Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnt2P50752 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms