Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa6P50704 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa6P50704 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa6P50704 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms