Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc13P50207 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms