Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms