Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpcP49452 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpcP49452 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpcP49452 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpcP49452 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpcP49452 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpcP49452 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpcP49452 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpcP49452 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpcP49452 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpcP49452 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpcP49452 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpcP49452 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpcP49452 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpcP49452 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpcP49452 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpcP49452 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms