Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms