Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms