Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VdrP48281 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VdrP48281 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VdrP48281 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VdrP48281 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VdrP48281 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VdrP48281 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VdrP48281 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VdrP48281 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VdrP48281 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VdrP48281 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VdrP48281 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VdrP48281 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VdrP48281 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VdrP48281 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VdrP48281 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VdrP48281 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VdrP48281 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VdrP48281 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VdrP48281 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VdrP48281 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VdrP48281 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VdrP48281 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VdrP48281 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms