Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrprbP47758 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrprbP47758 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms