Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf1P46099 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf1P46099 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms