Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sipa1P46062 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sipa1P46062 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sipa1P46062 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sipa1P46062 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sipa1P46062 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Sipa1P46062 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sipa1P46062 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sipa1P46062 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sipa1P46062 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sipa1P46062 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sipa1P46062 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sipa1P46062 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sipa1P46062 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sipa1P46062 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sipa1P46062 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sipa1P46062 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms