Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 281.4 ms