Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms