Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CskP41241 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CskP41241 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CskP41241 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CskP41241 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CskP41241 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms