Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbP41155 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbP41155 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbP41155 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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