Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd9P40240 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd9P40240 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms