Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ThpoP40226 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ThpoP40226 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ThpoP40226 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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