Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fen1P39749 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms