Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgclP38060 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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