Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lig1P37913 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms