Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprkP35822 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprkP35822 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprkP35822 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprkP35822 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprkP35822 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprkP35822 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprkP35822 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprkP35822 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtprkP35822 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprkP35822 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprkP35822 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprkP35822 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprkP35822 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprkP35822 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms