Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfc1P35601 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms