Protein–RNA interactions for Protein: P35375

Ptger1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger1P35375 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptger1P35375 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms