Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn11P35235 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn11P35235 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms