Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prim2P33610 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prim2P33610 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prim2P33610 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prim2P33610 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms