Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp13P33435 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp13P33435 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms