Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Saa4P31532 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Saa4P31532 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Saa4P31532 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms