Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms