Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sstr1P30873 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms