Protein–RNA interactions for Protein: P30557

Ptger3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger3P30557 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptger3P30557 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptger3P30557 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptger3P30557 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptger3P30557 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptger3P30557 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptger3P30557 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptger3P30557 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptger3P30557 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptger3P30557 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptger3P30557 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms