Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc1P29341 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms