Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprmP28828 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprmP28828 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprmP28828 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprmP28828 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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