Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kif5cP28738 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kif5cP28738 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms